Tous sur le pont : comment le Canada réoriente les initiatives de médecine de précision pour lutter contre la pandémie de COVID-19

Publié le: novembre 2020Catégories: Éditoriaux de la conférence 2020, Éditoriaux

Auteurs):

Athanasios Zovoilis, M.D., Ph.D.

Université de Lethbridge

Chaire de recherche du Canada en bioinformatique et génomique de l'ARN

Centre des sciences du génome du sud de l'Alberta (SAGSC)

Directeur

BioNet Alberta

Responsable académique

Angeliki Pantazi, M.D., Ph.D.

Centre des sciences du génome du sud de l'Alberta (SAGSC), Université de Lethbridge

Agent scientifique

Génome Intelligence Inc.

PDG

Athanasios Zovoilis, MD, PhD, Angeliki Pantazi, MD, PhD

La promesse de la médecine de précision

Médecine de précision est un domaine en évolution basé sur le principe que les informations dérivées des tests de diagnostic moléculaire peuvent aider les médecins à déterminer les traitements médicaux et les stratégies qui permettront d'obtenir des résultats cliniques optimaux pour leurs patients. Au lieu d'appliquer des solutions universelles, la médecine de précision vise à personnaliser les stratégies de prévention et les traitements en fonction du profil moléculaire de chaque patient. La mise en œuvre de la médecine de précision permet une meilleure gestion des maladies et garantit de meilleurs résultats pour la santé des patients, diminue le taux de réactions indésirables aux médicaments et facilite la découverte de médicaments.

La médecine de précision nécessite la génération d'une quantité extraordinaire de données biologiques, largement numérisées. Alors que la réalisation des tests de laboratoire devient de plus en plus peu coûteuse, le stockage, l'analyse et la conversion des données brutes en informations significatives restent le principal défi. De plus, le l'intégration d'informations biologiques avec des données cliniques et des preuves du monde réel pour prendre des décisions complètes sur l'appariement des patients aux traitements personnalisés est une tâche informatique exigeante et implique le partage de données qui sont souvent cloisonnées et inaccessibles. Pour gérer la richesse et la complexité sans précédent des données, le domaine a réussi à tirer parti de plusieurs niveaux d'expertise des disciplines de informatique, statistiques et intelligence artificielle. Ceux-ci ont façonné de nouveaux domaines de recherche tels que la bioinformatique et l'informatique de la santé/biomédicale et façonné une nouvelle génération de scientifiques des données axés sur la santé.

COVID-19 : Une tournure inattendue des événements

La médecine de précision est très pertinente pour relever les défis posés par la pandémie de COVID-19 car elle se situe à l'intersection des technologies de laboratoire perturbatrices, des mégadonnées biomédicales et des approches informatiques et analytiques de pointe. Elle ouvre ainsi la voie à la digitalisation de nos systèmes de santé. Le Canada a déjà investi considérablement dans une variété de projets scientifiques dans les universités et l'industrie qui visent à rapprocher les systèmes de soins de santé de la réalisation de la promesse de la médecine de précision. L'arrivée soudaine de la pandémie de COVID-19 a exigé des stratégies d'atténuation non conventionnelles, ce qui a déclenché un rassemblement d'experts en médecine de précision autour de la plus grande crise de notre vie. 

Parmi les premiers à réagir, Génome Canada (GC) a pris pas audacieux mobiliser l'écosystème canadien de la recherche dans cette direction. En tant que président et chef de la direction de GC, le Dr Rob Annan a récemment a souligné, « Le Canada est un chef de file mondial en matière de recherche en génomique liée à la santé. Capitaliser sur CGEn, l'établissement de CanCOGEN, un réseau scientifique pancanadien qui facilite le séquençage à grande échelle du matériel génétique viral et des patients pour accélérer le développement de médicaments et de vaccins, n'était qu'une question de semaines. Un brillant exemple de l'adaptabilité d'un flux de travail de médecine de précision établi pour une maladie caractéristique, comme le cancer, à la lutte contre le COVID-19 est le Centre canadien des sciences du génome Michael Smith au BC Cancer Research Institute, qui est l'un des nœuds du CanCOGeN. Parmi les autres initiatives réussies de médecine de précision qui sont mises à profit face à la pandémie, citons Prime à l'Université de Toronto et au CoVBanQ Biobanque COVID-19 établie par l'INSPQ (Institut National de Santé Publique du Québec). Dans la province de l'Alberta, plusieurs experts en médecine de précision possédant une expertise spécifique à un domaine travaillent actuellement pour lutter contre le COVID-19, y compris un certain nombre de initiatives de santé de précision à l'Université de l'Alberta et à Calgary, cette dernière accueillant l'important projet AB3C qui réutilise les pipelines de génomique médicale de précision développés pour l'élucidation des maladies rares afin d'étudier l'évolution de l'infection au COVID-19 chez les enfants. Comme un grand besoin pousse à la créativité, le Metabolomics Innovation Centre (TMIC) à Edmonton a lancé un outil de suivi en temps réel appelé COVIDmapper pour aider à visualiser la progression de la maladie dans le monde alors que DNAstack a construit une plate-forme accessible au public, Nuage COVID, pour aider les chercheurs dans l'analyse des données. Enfin, COVID-19 a démontré que le partage de données et les collaborations transinstitutionnelles sont essentielles dans la prestation actuelle des soins de santé. À cet égard, les efforts antérieurs de Genomics4RD avec des partenaires internationaux ont déjà compilé une liste attrayante Modèle de gouvernance pour établir une base solide pour l'accès aux données fédérées tout en atténuant les risques potentiels de confidentialité ou de sécurité.

Les gains de la médecine de précision

À son tour, le domaine de la médecine de précision ne sera plus jamais le même, car la pandémie de COVID-19 transforme radicalement les priorités, les objectifs et les collaborations des experts et des intervenants en médecine de précision. sa présentation développera ces perspectives d'avenir d'un domaine en pleine mutation. Nos expériences actuelles de COVID-19 en tant que société renforcent la confiance dans la science et capitalisent sur les investissements antérieurs dans les infrastructures de médecine de précision et les ressources informatiques, de capital humain et de réseau social. Il s'agit d'un échange gagnant-gagnant, car les systèmes de santé sont susceptibles d'accélérer l'adoption de la médecine de précision pour mieux traiter une gamme de problèmes de santé allant du cancer et des maladies cardiovasculaires à la crise du COVID-19.